南农合作发布兰州百合基因组

期次:第999期       查看:125

我校园艺学院联合国内多家科研团队公布了百合高质量染色体级别基因组,成为世界上首个正式报道的最大植物基因组。该基因组揭示了百合超大基因组的起源和形成机制,也揭示了鳞茎营养物质积累的遗传基础。研究成果得到多个资助和平台支持。


本报讯 10 月 24 日,我校园艺学院滕年军教授团队、薛佳宇副教授团队, 华中农业大学园艺林学学院宁国贵教授团队与福建农林大学明瑞光教授团队等国内 10 多家科研团队联合公布了百合高质量染色体级别基因组, 成为世界上首个正式报道的最大植物基因组。 相关文章“The evolutionary tale oflilies: Giant genomes derived from transposon insertions andpolyploidization”发表在《The Innovation》期刊。

基因组存储了一个物种的完整遗传信息, 是理解其生物学特性和进化历程的关键。 自然界中,不同生物的基因组揭示了生命之树上基因组大小的巨大差异, 其中一些植物拥有超大的基因组。 然而,这些超大基因组的起源和形成机制却不尽相同。 百合是单子叶百合目百合科多年生植物,因其极高的观赏、食用与药用价值而备受关注。本研究利用 Nanopore、Illumina 和 Hi-C 测序技术,以及优化的组装方法, 获得了 36.68 Gb 的兰州百合超大型基因组,并解析了其形成机制和特征, 也揭示了鳞茎营养物质积累的遗传基础。这一成果标志着百合的分子研究进入新时代,也是植物基因组学的重要突破性研究进展之一。

我校为该论文的第一署名单位和通讯单位,我校钟山青年研究员徐素娟博士、已毕业硕士张心祺、吴玉峰教授,华中农业大学博士生陈润洲以及上海市农科院杨柳燕研究员为论文的共同第一作者;滕年军、薛佳宇、宁国贵、明瑞光为论文共同通讯作者;北京林业大学、海南大学等单位 20 多位合作者参与本研究。 本研究得到了国家重点研发计划、江苏省种业振兴揭榜挂帅项目等资助和我校生物信息学中心高性能计算平台的支持。

(园艺学院)

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